История этой марки (изначально Patek, Czapek & Cie) восходит к истории Царства Польского, бывшего тогда частью России, точнее, к подавленному Россией в 1830 г. восстанию поляков. Основатель будущего всемирно знаменитого часового дома А. Патек вынужден был бежать из родной страны в нейтральную Женеву и на чужбине как-то кормить себя, торгуя чем придётся. Обнаружив, что лучше всего «идут» элитные часы, ничтоже сумняшеся стал закупать у разных мастеров часовые механизмы, для которых заказывал у лучших ремесленников соответствующего качества корпуса, и сам собирал часы. И вскоре его товар стал пользоваться большим успехом! За несколько лет Патек приобрёл себе имя и клиентуру, а в 1839 г. вместе с другим беглым поляком, Ф. Чапеком, основал свою фирму.

Спустя пять лет Патек знакомится с часовщиком Ж.-А. Филиппом, представившим миру уникальное на тот момент изобретение – часы с многофункциональной заводной головкой, при помощи которой можно было ещё и управлять переводом стрелок. И снова он, не колеблясь, принимает решение, пригласив талантливого мастера в свою фирму. В результате чего его прежний партнёр Чапек уходит из их общего дела и основывает собственное, а Филипп через несколько лет становится полноправным партнёром Патека, после чего компания берёт себе бренд Patek Philippe & Co. Это было очень удачное товарищество: талантливый Филипп занимался разработкой новых моделей и усовершенствованием механизмов, а энергичный и предприимчивый Патек расширял рынок сбыта. Часы этой славной мануфактуры покорили сердца многих именитых представителей императорских домов всего мира.

Именно мануфактура Patek Philippe & Co. первыми в мире выпустила наручные часы в виде браслета. В 1863 г. Филипп изобрёл скользящую заводную пружину, которая используется в современных автоматических часах. В 1868 г. Patek Philippe & Co. изготовили первые дамские наручные часы с механизмом, имеющим форму багета. Именно благодаря инициативе часового дома появляется знаменитое Женевское клеймо – знак качества, задавший мировую планку в обработке и декоре часовых механизмов. В 20 в. мануфактура получила патенты на такие известные часовые усложнения как вечный календарь, хронограф и минутный репетир.

В 1989 г. Patek Philippe S.A. изготовил самые сложные на тот момент часы Calibre 89, имевшие 33 усложнения. Именно карманные часы Henry Graves Supercomplication, изготовленные Patek Philippe S.A. в 30-е гг. 20 века по заказу миллионера Грейвза, поставили абсолютный мировой рекорд по стоимости, будучи проданными на аукционе за беспрецедентную сумму – почти 24 млн долларов США, и их же наручные часы Patek Philippe Ref. 1518, изготовленные в 1941 г., также побили рекорд стоимости – более 11 млн долларов.

С 2009 г. часовой дом пользуется собственным стандартом качества, над которым неустанно продолжает работать и по сей день, ставя перед собой всё более сложные и интересные задачи.